ولد الدكتور محمد حلمي في 25 يوليو 1901 ، لأب مصري وأم الألمانية في الخرطوم ، عاصمة السودان الحالية. انتقل حلمي إلى ألمانيا في عام 1922 ، حيث درس الطب. بعد الانتهاء من دراسته ، ذهب للعمل في مستشفى روبرت كوخ في برلين. أصبح رئيس قسم المسالك البولية.

شهد حلمي إقالة الأطباء اليهود من المستشفى بعدما استولى أدولف هتلر على السلطة في عام 1933 وطبق تشريع ضد اليهود. وفقا للقوانين العرقية النازية ، تم تصنيف حلمي على أنه "هاميت" بعد هام ، ابن نوح في العهد القديم. اعتمد هذا المصطلح من "العلوم العرقية" في القرن التاسع عشر واستُخدم لتصنيف أهالي شمال أفريقيا والقرن الأفريقي والمنطقة التاريخية في جنوب الجزيرة العربية. واعتبر أولئك الذين صُنّفوا على أنهم "هاميت" غير آريين وتعرضوا لمضايقات وللاضطهاد. تم طرد حلمي من المستشفى عام 1938 ومنع من ممارسة الطب. وبما أنه لم يعد بإمكانه الحصول على ترخيص طبي ، فتح حلمي عيادة خاصة دون ترخيص ومارس الطب في الخفاء. وبسبب عرقه ، مُنع أيضاً من الزواج من خطيبته الألمانية ، إمي إيرنست.

في 5 سبتمبر 1939 ، مباشرة بعد بدء الحرب العالمية الثانية ، تم تنفيذ الأمر المتعلق بمعاملة الأجانب الذي يتطلب من مواطني "الدول المعادية" التسجيل لدى الشرطة. ابتداءً من أكتوبر من نفس العام ، تم اعتقال العرب في ألمانيا ، والنمسا المحتلة ، وبولندا المحتلة ، وسجنوا ، وتم ترحيلهم إلى معسكر اعتقال ويلزبرج بالقرب من نورمبرج. تم احتجاز المصريين في ويلزبرج ليتم تبادلهم للمدنيين الألمان المعتقلين في مصر. وأمر وزير الخارجية الألماني يواخيم فون ريبنتروب باحتجاز اثنين من المصريين لكل ألماني محتجز في مصر. ألقي القبض على حلمي للمرة الأولى في 3 أكتوبر 1939 ، واحتُجز لمدة أربعة أسابيع في حجز الشرطة قبل نقله إلى ويلزبرج، حيث أصبح مريضاً للغاية. وأطلق سراحه والمصريين الباقين في أوائل ديسمبر عام 1939.

في 3 يناير 1940 ، أمر هاينريش هيملر ، زعيم الرايخ في قوات الأمن الخاصة والشرطة الألمانية ، باحتجاز جميع المواطنين المصريين الذكور الذين تتراوح أعمارهم بين 18 و 60 سنة. تم اعتقال حلمي مرة أخرى ، على الرغم من مرضه الخطير. لم يُفرج عن معظم المصريين المحتجزين في ويلزبرج حتى يونيو عام 1941. تمكنت السفارة المصرية من الإفراج المبكر عن حلمي في عام 1940 بسبب حالته الصحية السيئة. حتى مايو 1941 ، أُجبر عليه على إبلاغ الشرطة مرتين في اليوم وتقديم إثبات كل أربعة أسابيع بأنه غير مناسب للاعتقال.

بعد إطلاق سراحه ، تم تجنيد حلمي لعيادة الدكتور يوهانس فيدكيند في شارلوتنبورغ. وأثناء وجوده ، كتب مذكرات مريضة للعمال الأجانب لمساعدتهم على العودة إلى ديارهم وكذلك للألمان لمساعدتهم على تجنب التجنيد الإجباري للعمل الشاق أو خدمة المليشيات. عندما بدأت عمليات ترحيل يهود من برلين ، احتاجت آنا بوروس (لاحقاً غوتمان) ، وهي  إحدى المرضى اليهوديات من حلمي ، إلى مكان للاختباء. على الرغم من كونه مستهدفاً من قبل النظام النازي ، بسبب دونيته  العرقية ، وبتصريحه الناشط ضد النازيين ، قام حلمي بإخفاء بوروس حتى نهاية الحرب. في لحظات خطرة للغاية ، عندما كان يخضع لتحقيقات الشرطة ، رتب حلمي لبوروس للاختباء في مكان آخر ،إذ بذل كل ما في وسعه لحمايتها. حصل على شهادة من المعهد الإسلامي المركزي في برلين تشهد على  اعتناق بوروس الدين الإسلامي ، كما أحضر شهادة زواج (باللغة العربية) تثبت  بأنها متزوجة من رجل مصري في حفل أقيم في منزل حلمي. كما قدم حلمي المساعدة لوالدة بوروس جوليانا وزوج أمها ، جورج فير. وجدتها ، سيسيلي رودنيك. ساعد رودنيك وهو صديق ألماني له ,ليختفي في منزل فريدا شتورمان ، . ولمدة أكثر من عام ، أخفته شتورمان وشاركت حصصها الغذائية مع امرأة كبيرة السن.

في عام 1944 ، ألقي القبض على جوليانا فير وأثناء استجوابها ، كشفت أن حلمي كان يخفي ابنتها ، آنا. أخذ حلمي على الفور  بوروس إلى منزل شتورمان. طلب حلمي من بوروس أن تكتب له  رسالة تعترف له بأنها قد خدعته وكذبت عليه فيما يخص هويتها الحقيقية وأنها كانت قد غادرت  للبحث عن والدتها والبحث عن عمتها في ديساو. تمكن حلمي من تجنب الاعتقال من خلال عرض الرسالة على الجستابو.

وقد نجا كل من الدكتور محمد حلمي وإيمي إيرنستانا بوروس وجولي وجورج فير وسيسيلي رودنيك من الحرب بفضل حلمي  وشتورمان.  هاجرت العائلة إلى الولايات المتحدة بعد الحرب وبقي الدكتور حلمي في برلين وتمكن أخيراً من الزواج من خطيبته إيمي. مارس الطب حتى وفاته عام 1982.

في الخمسينيات والستينيات ، كتبت آنا بوروس وعائلتها رسائل نيابة عن حلمي وشتورمان إلى مجلس  المستشارين في برلين. عندما تم اكتشاف هذه الرسائل في محفوظات برلين ، تم تقديمها إلى مؤسسة ياد فاشيم "البار من بين الأمم". تم تكريم محمد حلمي وفريدا شتورمان كأبار من بين الأمم في مارس 2013. وكان حلمي أول منقذ عربي يحصل على اللقب.