A partir del 15 de marzo de 1939, la comunidad religiosa judía en Praga determinó que aproximadamente 125.000 judíos, según lo “definido” en las Leyes Raciales de Núremberg de 1935, vivían en el territorio del Protectorado de Bohemia y Moravia. En contraste, el 1 de octubre de 1941, la comunidad religiosa judía pudo identificar a 88.105 personas, una reducción de 37.000, debido principalmente a la emigración legal (26.000) e ilegal (5.000 a 6.000). Más de la mitad vivía en Praga.

Inicialmente, los líderes de la comunidad de Praga recibieron con agrado la existencia del campo-ghetto de Theresienstadt, creyendo que la concentración de los judíos checos en tierra checa era preferible a la deportación al este. Antes del establecimiento del campo-ghetto, los alemanes habían deportado a cerca de 6.000 judíos checos en seis transportes: cinco desde Praga al ghetto de Lodz, y uno desde Brno a Minsk, Bielorrusia.

En diciembre de 1941, las SS designaron al líder sionista Jacob Edelstein como presidente del Consejo Judío de Ancianos en el campo-ghetto. Cuando Edelstein llegó a Theresienstadt el 4 de diciembre de 1941, él y sus colaboradores estaban decididos a evitar más deportaciones al este. Para esto organizaron una comunidad productiva con fondos propios que a los alemanes les resultaría indispensable para su participación en la guerra.

Entre el 24 de noviembre de 1941 y el 15 de abril de 1945, las autoridades alemanas deportaron a Theresienstadt entre 73.608 y 73.958 judíos que vivían en el Protectorado de Bohemia y Moravia. Los deportados llegaron en 98 trenes, en grupos de tantas como 1.000 o tan pocas como 50 personas. Algunos judíos del Protectorado llegaron en grupos aun más pequeños, o individualmente.

En 1941, 7.365 judíos del Protectorado llegaron a Theresienstadt. Durante 1942, el año pico de la implementación de la política de la “solución final” de los nazis, 54.627 judíos del Protectorado llegaron a Theresienstadt. En 1943, Theresienstadt alojó a otras 7.877 personas procedentes del Protectorado; en 1944, solo a 420; y finalmente, en 1945, a 3.669. Antes de junio de 1942, los judíos del Protectorado eran los únicos “residentes” de Theresienstadt. Esto cambió en 1942: comenzando con un transporte de 50 judíos de Berlín que llegaron el 2 de junio de 1942, las autoridades alemanas deportaron a Theresienstadt judíos de Alemania, Austria, Danzig, Luxemburgo y los Sudetes.

Entre el 15 de octubre de 1941 y el 27 de octubre de 1944, las SS y la policía alemana deportaron entre 75.000 y 80.000 judíos checos de Bohemia y Moravia a centros de exterminio o campos de trabajos forzados en el Generalgouvernment*, los estados bálticos bajo ocupación alemana, Bielorrusia bajo ocupación alemana y el ghetto de Lodz. Los alemanes deportaron 60.382 judíos del Protectorado por Theresienstadt a centros de exterminio y campos de trabajos forzados en el este. Estos 60.382 judíos representaban cerca del 82% de la cantidad total de personas llegadas al campo-ghetto. Según se conoce, menos de 3.100 de estos deportados sobrevivieron. Además, 6.152 judíos checos murieron en el ghetto, por lo cual posiblemente hayan quedado unos 7.000 sobrevivientes judíos checos en mayo de 1945.

Theresienstadt cumplió con una escalofriante eficacia su función como estación de tránsito para los centros de exterminio.

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* Generalgouvernement: la parte de la Polonia bajo ocupación alemana no anexada directamente al Reich alemán ni anexada a regiones de la Unión Soviética bajo ocupación alemana.