Τα μέλη των SS, του επίλεκτου σώματος του ναζιστικού καθεστώτος, διαδραμάτισαν καίριο ρόλο στην «Τελική Λύση», το σχέδιο ριζικής εξόντωσης των Εβραίων της Ευρώπης. Ο επικεφαλής των SS, Χάινριχ Χίμλερ και οι υφιστάμενοί του, Ράινχαρντ Χάιντριχ (Reinhard Heydrich), Κουρτ Νταλουέγκε (Kurt Daluege) και άλλοι, δημιούργησαν τα SS και ένα αστυνομοκρατούμενο κράτος υπό τον Αδόλφο Χίτλερ, ενώ πρωτοστάτησαν στις προσπάθειες υλοποίησης της ιδεολογικής ατζέντας του καθεστώτος. Με αυτό το στόχο, τα SS διέπραξαν αμέτρητες μαζικές δολοφονίες. Τα SS και στελέχη της αστυνομίας διεύθυναν τα Einsatzgruppen (κινητές μονάδες εξόντωσης) στην ανελέητη και συστηματική δολοφονία ανδρών, γυναικών και παιδιών εβραϊκής καταγωγής στους χώρους εκτέλεσης της κατεχόμενης Σοβιετικής Ένωσης. Στην κατεχόμενη Πολωνία τα SS ίδρυσαν στρατόπεδα εξόντωσης εξοπλισμένα με θαλάμους αερίων δημιουργώντας ένα βιομηχανοποιημένο σύστημα μαζικής δολοφονίας.

Ένα σχέδιο εξόντωσης όμως σε τέτοια κολοσσιαία κλίμακα δεν ήταν δυνατό να διεκπεραιωθεί μόνο από τα SS. Η υλοποίηση της «Τελικής Λύσης» απαιτούσε τη συνεργασία και τη συμμετοχή της στρατιωτικής γραφειοκρατίας και των πολιτικών αρχών της Γερμανίας στις κατεχόμενες χώρες. Οι επιχειρήσεις μαζικού εκτοπισμού απαιτούσαν τη συνεργασία του Άντολφ Άιχμαν του Κεντρικού Γραφείου Ασφαλείας του Ράιχ, του Άλμπερτ Γκάνζμουλερ (Albert Ganzenmueller) των Γερμανικών Κρατικών Σιδηροδρόμων και του Γιοαχίμ φον Ρίμπεντροπ (Joachim von Ribbentrop) του γερμανικού Υπουργείου Εξωτερικών. Η Βέρμαχτ (οι γερμανικές ένοπλες δυνάμεις) παρείχε στα Einsatzgruppen μεταφορικά μέσα και προμήθειες, ενώ συμμετείχε και στις μαζικές δολοφονίες Εβραίων και άλλων Σοβιετικών αμάχων και ειδικότερα Σοβιετικών αιχμαλώτων πολέμου. Η Reichsbank, η κεντρική τράπεζα της Γερμανίας με επικεφαλής τον Βάλτερ Φουνκ (Walther Funk), λειτουργούσε ως χώρος φύλαξης κλεμμένων χρημάτων και χρυσού και βοήθησε στη χρηματοδότηση των επιχειρήσεων δολοφονίας από τα SS. Γερμανοί γιατροί και υγειονομικό προσωπικό εφάρμοσαν το ναζιστικό πρόγραμμα «Ευθανασία» δολοφονώντας δεκάδες χιλιάδες άτομα με σωματικές και πνευματικές αναπηρίες. Άλλοι γιατροί πραγματοποίησαν ανήθικα και απάνθρωπα ιατρικά πειράματα και πρωτοστάτησαν σε «επιλογές» στα κέντρα εξόντωσης καθορίζοντας ποιοι κρατούμενοι θα ζούσαν και ποιοι θα θανατώνονταν. Ιδιωτικές βιομηχανικές επιχειρήσεις της Γερμανίας όπως η I.G. Farben και η Krupp χρησιμοποίησαν εξαναγκασμένους εργάτες. Μια θυγατρική της I.G. Farben προμήθευε το αέριο Zyklon B που χρησιμοποιούνταν για τη δολοφονία ανθρώπων στους θαλάμους αερίων.