Хотя евреи были главными жертвами фашистского режима, нацисты и их союзники подвергали гонениям по расовым и идеологическим мотивам и другие группы людей. Одними из первых жертв нацистской дискриминации стали политические оппоненты режима — коммунисты, социалисты, социал-демократы и руководители профсоюзов. Нацисты также преследовали писателей и художников, работы которых расценивались как «вредные» или если те были евреями; их могли арестовать, наложить денежные санкции или подвергнуть иным формам дискриминации. По расовым мотивам фашисты преследовали также и цыган. Цыгане стали одними из первых, кто погиб в «газвагенах» польского лагеря смерти Хелмно. Нацисты депортировали более 20 000 цыган в концлагерь Освенцим (Аушвиц-Биркенау), где большинство из них было уничтожено в газовых камерах. Поляков и прочих славян нацисты рассматривали как «низшую расу». Поляки, которых гитлеровцы считали идеологически опасными (включая интеллигентов и католических священников), направлялись на казнь. С 1939 по 1945 год не менее 1,5 млн. польских граждан было депортировано в Германию на принудительные работы. Еще сотни тысяч были заключены в нацистские концлагеря. Количество поляков нееврейского происхождения, уничтоженных гитлеровцами, оценивается по крайней мере в 1,9 млн. человек.

Осенью и зимой 1941–1942 годов немецкими властями на оккупированной территории Советского Союза был реализован расистский план массового уничтожения советских военнопленных: евреи, люди с «азиатскими чертами лица» и высокопоставленные политические и военные руководители были отделены от остальных и расстреляны. Около трех миллионов оставшихся военнопленных были помещены во временные лагеря, где не было ни нормального укрытия от непогоды, ни пищи и лекарств и где, по замыслу нацистов, они должны были умереть. В Германии нацисты арестовывали тех христианских церковнослужителей, которые осмеливались им возражать, а также тысячи Свидетелей Иеговы, отказывавшихся салютовать Адольфу Гитлеру или служить в немецкой армии. В процессе реализации так называемой «Программы эвтаназии» фашисты убили около 200 000 людей с умственными и физическими недостатками. Кроме того, нацисты преследовали гомосексуалистов, чье поведение они считали угрозой сохранению германской нации.