Нацистские лагеря смерти были предназначены для массового уничтожения людей. В отличие от концентрационных лагерей, которые служили в первую очередь тюрьмами и каторгами, лагеря смерти (также называемые лагерями уничтожения) были исключительно «фабриками смерти». СС и немецкая полиция уничтожили в лагерях смерти около 2 700 000 евреев, при этом практиковалось удушение ядовитым газом либо расстрелы. Первым лагерем смерти был Хелмно, открытый в декабре 1941 года на территории Польши в регионе, аннексированном Германией. Главным образом евреев, а также цыган там отравляли выхлопными газами в специально оборудованных для этих целей автомобилях –«газвагенах». В 1942 году нацисты открыли лагеря смерти Белжец, Собибор и Треблинка (они известны под общем названием лагерей операции «Райнхард»), предназначенные для методичного убийства польских евреев. В лагерях смерти, относившихся к операции «Райнхард», сотрудниками СС и их вспомогательными подразделениями с марта 1942 по ноябрь 1943 года были убиты приблизительно 1 526 500 евреев.

Почти все депортированные лица, привезенные в лагеря смерти, сразу же отправлялись в газовые камеры. Крупнейшим лагерем смерти был Освенцим (Аушвиц-Биркенау); к весне 1943 года там работали четыре газовые камеры, в которых использовался ядовитый газ «Циклон Б». В период массовых депортаций в этом лагере каждый день умерщвляли газом до 6 000 евреев. К ноябрю 1944 года в Освенциме погибли более миллиона евреев, а также десятки тысяч цыган, поляков и советских военнопленных. Служба СС хранила информацию о лагерях смерти в строгом секрете. Чтобы уничтожить все следы использования отравляющих газов, специальные группы заключенных должны были удалять трупы из газовых камер и кремировать их. В конце войны камеры были демонтированы, а их остатки замаскированы, чтобы скрыть следы массовых убийств.