Гитлеровский режим часто подвергал еврейских и других женщин особо жестоким преследованиям, которые иногда были предназначены исключительно для женщин. Некоторые отдельные лагеря и особые зоны внутри некоторых концлагерей предназначались специально для заключенных женщин. В мае 1939 года служба СС открыла Равенсбрюк, самый крупный из нацистских лагерей, построенных специально для содержания женщин. К моменту освобождения Равенсбрюка советскими войсками в 1945 году в лагере было заточено более 100 000 женщин. Беременных еврейских женщин и матерей с маленькими детьми направляли в центры уничтожения, где начальство лагеря часто включало их в первые же группы, посылаемые на смерть в газовых камерах. Как в лагерях, так и в гетто, женщины часто подвергались побоям и изнасилованиям. Беременные еврейские женщины нередко пытались скрыть свое положение, иначе им принудительно делали аборт. Немецкие врачи использовали еврейских и цыганских женщин в качестве подопытных субъектов для экспериментов по стерилизации.

Женщины играли важную роль в деятельности сил сопротивления, особенно те из них, которые были вовлечены в социалистическое, коммунистическое или молодежное сионистское движение. Многим женщинам удалось бежать в леса Восточной Польши и Советского Союза, где они воевали в вооруженных партизанских отрядах. Некоторые женщины были участниками или руководителями организаций сопротивления в гетто. Другие участвовали в акциях сопротивления внутри концентрационных лагерей. Пять заключенных евреек достали порох, который позднее был использован для подрыва газовой камеры и убийства нескольких эсэсовцев во время восстания в лагере смерти Освенцим (Биркенау) в октябре 1944 года. Миллионы женщин преследовались и погибали в эру Холокоста. Однако в конечном счете жертвами нацизма их сделала не половая принадлежность, а их положение в нацистской расовой иерархии, религиозные или политические убеждения.