Будучи главными жертвами нацистов, евреи, не смиряясь, разными способами сопротивлялись угнетению, действуя как вместе, так и поодиночке. Наиболее мощной формой противостояния евреев нацистам в оккупированной Германией Европе было организованное вооруженное сопротивление. На оккупированной территории Польши и Советского Союза более чем в ста гетто еврейское население вставало на борьбу с захватчиками. Самым ярким примером такой борьбы является вооруженное восстание евреев Варшавского гетто в апреле–мае 1943 года, где люди атаковали немецкие танки бутылками с горючей смесью, ручными гранатами и стрелковым оружием, имевшимся у них в небольшом количестве. Германским войскам потребовался почти месяц, чтобы полностью подавить это восстание. В трех лагерях смерти еврейские заключенные также восставали против своих тюремщиков. В Треблинке в августе 1943 года и в Собиборе в октябре 1943 года заключенные, вооружившись украденным оружием, напали на охрану лагеря. Большинство повстанцев было уничтожено немцами и их союзниками. В октябре 1944 года заключенные лагеря смерти Освенцим-Биркенау восстали против охраны. Почти 250 заключенных погибли в бою; после подавления восстания эсэсовские охранники расстреляли еще 200 человек.

Во многих странах, оккупированных Германией или сотрудничавших с ней, еврейское сопротивление зачастую принимало форму помощи и спасения. По всей оккупированной гитлеровцами территории Европы многие евреи помогали другим евреям найти убежище, доставали для них продукты питания и снабжали фальшивыми документами, спасшими многие жизни. В 1944 году еврейские органы самоуправления Палестины тайно направляли парашютистов в Венгрию и Словакию, чтобы помогать скрывавшимся там евреям. Десятки тысяч евреев сражались в рядах национальных движений сопротивления в Бельгии, Франции, Италии, Польше, Югославии, Греции и Словакии, а также в советских партизанских отрядах. Евреи в гетто и лагерях отвечали на притеснения нацистов еще и «духовным сопротивлением», принимавшим самые разные формы. Стараясь сохранить образ жизни и достоинство еврейского народа, они создавали подпольные культурные организации, отмечали еврейские праздники, исполняли запрещенные религиозные ритуалы, проводили тайные учебные занятия, издавали подпольные газеты, собирали и прятали документы.